天顺元年（1457年），明英宗朱祁镇复辟。大将石亨等人诬陷于谦图谋立襄王之子，最终使得忠诚一生的于谦冤屈致死。
于谦一生忧国忘家，始终以国家利益为重，个人功劳从不张扬，生活简朴，居住的地方连遮风挡雨的地方都非常简陋。而且正是他在土木堡之变后，率领二十二万大军，列阵在北京的九门之外，与瓦剌大军奋力抵抗，才成功挽救了明朝，避免了国家的灭亡。如此忠臣，明英宗朱祁镇怎么会看不出来呢？实际上，朱祁镇心里明白于谦的功劳，但他依然决定除掉他。为了理解这一点，我们先来回顾一下朱祁镇的一生。他是明宣宗朱瞻基的长子，与朱祁钰是同父异母的兄弟。朱祁镇九岁继位，年号“正统”，但当时国家大事都由太皇太后张氏把持，政府由三位贤臣管理。等到太皇太后去世，三位贤臣也逐渐失势，宦官王振开始掌权，导致宦官干政。直到正统十四年（1449年），土木堡之变发生，朱祁镇被瓦剌俘虏，弟弟朱祁钰登基称帝，改元景泰。朱祁镇被软禁在南宫。直到景泰八年（1457年），石亨等人发动夺门之变，朱祁镇得以复位，第二次称帝，改年号为天顺。回顾朱祁镇的前半生，他虽然曾一度没有实权，但当上皇帝后又被俘，经历了颠沛流离的生活。所以，当他再次掌握政权后，他当然不容忍任何可能威胁到自己地位的人。
那么，于谦到底威胁了朱祁镇什么呢？最初，朱祁镇并不打算杀于谦。当时，参与夺门之变的徐有贞向朱祁镇提议杀掉于谦时，朱祁镇回应道：“谦实有功”，这句话表明他并不想杀于谦。但徐有贞随即说了一句话，改变了朱祁镇的心思：“不杀于谦，此举无名。”意思是，如果不杀掉于谦，自己发动政变就失去了正当理由。朱祁镇心中非常重视“正统性”，因为明朝深受程朱理学的影响，极为看重皇位的正当性。而他当初的年号就是“正统”，甚至朱棣当年篡位时，都费尽心思为自己的称帝找正当理由。所以，经过深思熟虑，朱祁镇决定杀掉于谦。但事实上，于谦当时握有兵权，如果他反抗，完全可以造反。那么，为什么他最终还是交出兵权，被杀呢？因为于谦早已意识到自己难逃一死，而朱祁镇要保持“正统性”，必须铲除他。令人惋惜的是，作为一位忠诚的臣子，于谦就这样含冤离世。
之后，朱祁镇虽然为杀害于谦深感后悔，但却无力挽回局面。在他之后的几任明朝皇帝，都努力为于谦平反。在明宪宗时期，于谦被复职并获赐祭，弘治二年（1489年）追谥“肃愍”。到了明神宗时期，于谦的谥号改为“忠肃”。尽管朱祁镇在其后任用了贤臣李贤，废除了残忍的殉葬制度等一系列善政，但他冤杀于谦的事实，始终成为他一生的污点，令他成为历史上最具争议的皇帝之一。
最后，与岳飞、张煌言并称“西湖三杰”的于谦，留下了他的诗作《石灰吟》：“千锤万凿出深山，烈火焚烧若等闲。粉身碎骨浑不怕，要留清白在人间。”他忠诚、正直的精神，将永远活在后人心中。